浙江大学。
1、第四轮学科评估，复旦大学有5个A+学科，8个A学科，10个A-学科，共23个A类学科，这23个A类学科中，最主要集中的学科门类是人文社科、医学、理学以及管理学；有17个学科进入了世界前1%，其中化学、材料科学、临床医学进入了全球前1%。
2、第四轮学科评估，浙江大学A+数量达到了11个，排在全国第三，仅次于清华大学和北京大学的21个A+；浙江大学获得了11个A，17个A-，共39个A类学科的好成绩。
这39个A类学科中，人文社科、理学、工学、管理学以及农学类的学科最多；有18个学科进入世界前1%，有8个进入世界前%，5个学科进入世界前50位。
3、浙江大学大学有本科专业128个；复旦大学有本科专业76个。浙江大学有一级学科硕士学位授权点62个；复旦大学有一级学科硕士学位授权点43个。
浙江大学有一级学科博士学位授权点59个；复旦大学有一级学科博士学位授权点37个。
浙江大学有博士后科研流动站57个；复旦大学有博士后科研流动站35个。
4、浙江大学有一级国家重点学科14个，二级国家重点学科21个，国家重点实验室10个，国家工程研究中心6个；复旦大学有国家重点实验室5个。教育部工程研究中心7个，教育部重点实验室4个。
5、复旦优势文理医，浙大优势工农，文理医也都是前十的水平，但地域当然是上海比杭州好，总体水平在伯仲之间。结合具体情况来看，浙江大学的整体学科比复旦大学好一些。当然，这两所都是非常优秀的好大学，应该客观的评价，具体到某一学科的实力上面。
以上内容参考：百度百科-浙江大学、百度百科-复旦大学
