600字范文,内容丰富有趣,生活中的好帮手!
600字范文 > 蛋白质组学数据分析实践

蛋白质组学数据分析实践

时间:2023-06-26 11:03:32

相关推荐

蛋白质组学数据分析实践

一、参考文章:

The Primary Effect on the Proteome of ARID1A-mutated Ovarian Clear Cell Carcinoma is Downregulation of the Mevalonate Pathway at the Post-transcriptional Level

目标

理清文章思路

总结描述蛋白质组学部分的内容和流程

标示出与蛋白质组学相关的软件及需要下载的内容(如数据、软件)

二、下载软件

MaxQuant软件网址:MaxQuant

截图

听说要填写一些基本信息才能进行下载,那就填呗(我没下载)

三、蛋白质组学原始数据下载

根据原文方法部分给出的说明进行下载

数据储存在ProteomeXchange网站里:,文章给出了ID:PXD004570

输入ID之后,点击搜索,会出现如下图所示信息:

出现如下信息,选择raw文件夹,进入每个样品信息:

末尾小提示:

因为单个蛋白质组学测定的样品数据量都是比较大的(其实按道理来讲,基于质谱的数据都需要比加大的内存),这里教程的出品人建议从后续的第五讲开始学习,跳过原始数据下载和处理这一步,嘿嘿------

本内容不代表本网观点和政治立场,如有侵犯你的权益请联系我们处理。
网友评论
网友评论仅供其表达个人看法,并不表明网站立场。