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脑科学日报:AI算法血检T细胞 癌症早发现;衰老的秘密

时间:2020-01-01 00:09:16

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脑科学日报:AI算法血检T细胞 癌症早发现;衰老的秘密

1,《科学》子刊:血检T细胞,癌症早发现!科学家开发针对T细胞受体的AI算法,对多种早期癌症AUC超0.95

来源:奇点网

近期《科学转化医学》杂志上的一篇研究中,科学家们开发了一种针对T细胞受体(TCR)的深度学习算法,从外周血T细胞的反应来寻找癌症发生的蛛丝马迹。在验证队列中,这个名为DeepCAT的算法针对多种早期癌症都能达到较高的准确性,曲线下面积(AUC)≥0.95!

在已有研究基础上,研究者们猜想:癌症相关T细胞受体(caTCRs)可能具有共同的生化特征。研究者选择从TCGA中获取数据,他们从覆盖了32个癌种的4200份肿瘤RNA测序样本中提取了TCR的CDR3部分。CDR3是TCR与抗原直接接触的部分,变化程度非常大,是相关研究常用的靶序列。这些数据经过处理,又排除了在健康人中也存在的CDR3序列,最终得到了43000个可用的数据来训练算法。在DeepCAT算法模型中,每个CDR3序列被转化为二维图像,通过PCA编码,整合了相关氨基酸指数,经过两层卷积网络,增加40%的随机偏差防止过拟合,最终输出癌症相关的概率。经训练,算法通过单一CDR3识别的平均精度达到80%。

2,Trends Genetics: 是什么决定小鼠,狗或人的寿命?研究揭示衰老的秘密

来源:细胞

是什么决定了小鼠,鳄鱼,狗或人的寿命?生态学院和萨凡纳河生态实验室的研究团队Emily Bertucci和Benjamin B. Parrott提出了一个强有力的案例,说明其机理在于基因组与表观基因组的交集。

博士研究生Bertucci和助理教授Parrott以最近发表的表观遗传学数据为基础,这些数据是由于基因表达修饰而非遗传密码改变而引起的生物体变化的基础。他们最近发表在《Trends in Genetics》杂志上的文献综述指出,表观遗传衰老的很大一部分发生在CpGs区域。CpG是位于DNA序列上的特定区域,其中化学元素胞嘧啶和鸟嘌呤通过磷酸键连接。研究人员称,在CpGs的密度之外,环境因素和压力也可能对寿命起重要作用。

3,血压轻度升高,人也不知不觉变“傻”!牛津大学2万人研究提示血压改变大脑结构

来源:医学新视点

血压、血糖异常是痴呆症的危险因素,而且这种影响可能早早悄然出现。牛津大学研究团队在《自然-通讯》最新发表的一项大型研究为此提供了新证据。研究发现,在大脑健康人群中,高血压和糖尿病会对思维速度和记忆产生不利影响,尤其是随着血压的升高,认知表现越来越差。

这项研究主要针对中年人群,纳入了英国生物样本库(UK Biobank)的2.2万多名44-73岁的大脑相对健康的受试者(没有阿尔茨海默病、神经系统疾病等),并通过大脑影像学检查和认知测试来评估其认知和执行功能。研究团队总结提出,在相对健康的人群中,脑血管危险因素,也会影响大脑结构和认知功能。“尽管只是思维速度和记忆力的轻微下降,人们在日常生活中甚至不会注意到。但可以检测出这种变化,就说明受试者的大脑已经发生了改变,而且可能随着年龄增长而恶化。”

4,Nat Comm | 孙育杰/李栋团队合作揭示线粒体DNA分配新机制

来源:BioArt

图注:线粒体动态管化介导拟核运输的分子机制模型

9月8日,北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)孙育杰课题组与中国科学院生物物理所李栋课题组合作,在Nature Communications杂志上发表文章ER-mitochondria contacts promote mtDNA nucleoids active transportation via mitochondrial dynamic tubulation,报道了线粒体拟核的一种新型分配机制。

文章提出线粒体拟核可以通过起始于内质网与线粒体互作位置的动态管化进行运输,并对其分子机制进行了探究。该模型对解释线粒体拟核在线粒体网络中的分布提供了新的视角,对研究线粒体拟核在相关疾病以及衰老中的功能具有重要意义。

5,JAMA子刊:脑出血患者使用SSRI之后

来源:医脉通精神科

选择性5-HT再摄取抑制剂(SSRI)通常被视为卒中后抑郁的一线治疗手段,但同时可能与首发脑出血(ICH)风险升高相关,机制可能为抗血小板效应。麻省总医院及哈佛医学院Alessandro Biffi博士及其合作者针对1279名原发性ICH患者(平均年龄71.3岁)开展了中位时长53.2个月(四分位距42.3-61.2个月)的随访,其中女性602人,白人占大多数(1049人)。随访期间,128人出现了ICH复发(每年4.2%),766人(60%)被诊断为抑郁。

研究显示,SSRI可有效减轻ICH患者的抑郁症状,但同时也与ICH复发风险升高显著相关,尤其是那些存在某些高危特征、本身复发风险即较高的患者。该研究近日发表于JAMA Neurology。

6,失眠者竟然比正常人患2型糖尿病概率高17%

来源:转化医学网

由瑞典斯德哥尔摩卡罗林斯卡研究所的副教授Susanna Larsson和Shuai Yuan利用“孟德尔随机化分析法”进行的一项研究发现:失眠与2型糖尿病风险增加之间存在因果关系。研究于9月8号发表在《Diabetologia》上,文章题为“An atlas on risk factors for type 2 diabetes: a wide-angled Mendelian randomisation study”。

该研究使用孟德尔随机分析法(MR)来确定2型糖尿病的危险因素。一共确定了34个影响因素(19个危险因素和15个保护因素)。另外还有21个潜在危险因素(例如饮酒、不吃早餐、白天午睡、睡眠不足、尿钠水平以及氨基酸代谢调控的炎症因子等)。

7,中科院心理所研究发现社会阶层影响儿童亲社会行为

来源:中科院心理所

心理学研究表明,社会阶层会影响人们的审美偏好、语言、身体健康,幸福感。不仅如此,社会阶层也会影响人们的行为倾向,例如他们的亲社会行为。亲社会行为是指人们有意而为的、对他人有益的行为,包括分享、合作、帮助、捐赠和安慰等。

近期,中国科学院行为科学重点实验室李纾研究组的博士生匡仪与宁波大学心理学系教授汪祚军开展合作研究,探讨社会阶层如何影响人们的亲社会行为。结果发现,亲社会行为不仅取决于实施者所处的社会阶层,也取决于亲社会行为所指向的对象所处的社会阶层。儿童的亲社会行为会受其自身所处社会阶层以及对方所处的社会阶层的影响;因此,不能笼统地说高社会阶层的人更亲社会还是低社会阶层的人更亲社会。

8,“减少损伤+加强修复”!百时美Zeposia治疗复发型多发性硬化症(RMS)具有长期疗效和安全性!

来源:生物谷

多发性硬化症(MS)是一种免疫系统攻击覆盖神经的保护性髓鞘的疾病。髓鞘损伤可破坏大脑和身体其他部分之间的通讯。最终,神经本身可能恶化,这一过程目前是不可逆的。

百时美施贵宝(BMS)近日在MSVirtual 大会第8届联合ACTRIMS-ECTRIMS会议上公布了多发性硬化症新药Zeposia(ozanimod)3期开放标签扩展试验DAYBREAK的中期结果,证实了Zeposia对复发型多发性硬化症(RMS)患者的长期疗效和安全性:大多数患者在治疗第24个月和第36个月时无复发,没有出现新的安全问题。

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