1、农业防治：
农业防治是利用栽培措施来控制病虫害的技术，具有投资少、无污染、副作用小的特点。
①选用抗病虫品种。在西瓜病虫害农业防治中，选择抗病虫品种是经济有效的措施。目前西瓜生产上应用的抗病品种大多是对西瓜枯萎病具有抗性的品种，如西农8号、郑抗1号、郑抗2号、郑抗3号等，这些品种的应用能够有效地预防西瓜枯萎病的发生。另外，中国农业科学院郑州果树研究所培育的郑抗8号对西瓜炭疽病、叶枯病具有较强的抗性，对西瓜的病毒病具有一定的耐病性。
②实行轮作。能调节地力，有效控制同类病害的再度发生。西瓜是一种忌连作的作物，但随着西瓜抗枯萎病品种的应用以及嫁接栽培技术的推广，西瓜忌连作的问题已得到解决，连作面积越来越大。随着连作年限的增加，同种病原菌在土壤中的存活量日益增加，势必会引起除枯萎病以外的其他土传病害的严重发生，从而加大农药用量，引起污染。所以即使采用抗病品种和嫁接栽培技术，连作的年限也应严格限制，最好不要超过3年。
③清除杂草。清除瓜田及其周围的杂草，可减少病原微生物和害虫的越冬寄生，减少第二年的病源、虫源。冬前及时深耕，可将地表的病菌及害虫翻入土中或将深层越冬（夏）病虫暴露于地面，使其窒息或冻晒而死。
④保护地栽培。进行保护地全园覆盖地膜隔离栽培，空气湿度小，营造了有利于西瓜生长而不利于病原菌繁殖的环境条件，在保护地的放风口采用防虫网进行隔离，可有效防止蚜虫等害虫向棚内迁飞。
⑤嫁接换根。嫁接换根可有效防止西瓜枯萎病的发生。
2、生物防治：
生物防治指的是利用有益生（包括生物制剂）防治西瓜病虫害，对环境无污染，对人、畜无害，且安全可靠，前景广阔。如用F86-5菌剂在西瓜播种时用来浸种或穴施，可有效控制西瓜枯萎病，效果明显优于多菌灵。
3、物理防治：
物理防治主要是利用温、光、色等物理措施来防治病虫害，常用方法如下：
①温烫浸种。可杀死附着在种子表面上的病菌。
②银灰色塑料膜避蚜虫。银灰色反光塑料膜透光率为15%,反光率＞35%，反射光中带有红外线，对蚜虫有驱避作用。瓜田可采用铺银灰色膜和在设施通风口处挂银灰色膜条的办法驱避蚜虫，丛而减轻蚜虫和病毒病发生。
③黄色诱板。蚜虫、白粉虱都有趋黄色习性，田间可用黄色黏板或黄盆诱蚜；大棚温室可在通风口挂黄色黏着条诱杀蚜虫及白粉虱。
4、化学防治：
指的是利用化学农药防治西瓜病虫害仍是现阶段的重要手段，但是无公害西瓜生产应尽量贯彻“预防为主，综合防治”的方针，在提高西瓜自身抗病性的基础上，优先采用农业、生物和物理的防治方法，其次再采用低毒高效的农药防治。
①严禁在西瓜上使用高毒、高残留的农药。中华入民共和国农业部2002年第194号和199号公告公布了在蔬菜上禁用的农药品种：六六六，滴滴涕，毒杀芬，二溴氯丙烷，除草醚，艾氏剂，狄氏剂，汞制剂，砷、铅类，敌枯双，氟乙酰胺，甘氟，毒鼠强，氟乙酸钠毒鼠硅，甲胺磷，甲基对硫磷，对硫磷，久效磷，磷胺，甲拌磷，甲基异柳磷，特丁硫磷，甲基硫环磷，治螟磷，内吸磷，克百威，涕灭威，灭线磷，硫环磷，毒蝇磷，地虫硫磷，氯唑磷，苯线磷，氧化乐果，水胺硫磷。这些农药同样在西瓜上禁止使用。
②安全用药。使用化学农药时，应掌握农药的使用次数和安全间隔期（最后一次施药至西瓜收获时允许的间隔天数）。农药混剂的安全间隔期按其中残留最大、安全间隔期长的执行。
③合理施药。合理混用、轮换交替使用不同作用机制或具有负交互抗性的药剂，克服和推迟病、虫抗药性的产生和发展。
