大数据资料对个人数据的运用，有一个比较惯常的做法，就是 “脱敏”、“去标识化”，对个人隐私产生影响的内容一定要去掉，才能就某一种疾病进行大数据的挖掘分析。
二是对涉及健康医疗数据的整个管理要有一套严格的法律法规。主要是建立数据安全管理制度，注重内容安全和技术安全。
加强“脱敏”信息和隐私保护的双重研究，一方面研究这些信息成为公共开放数据的可能性以及实现路径，另一方面要着力保护好涉及到个人隐私的方方面面。
三是借鉴国际经验，加强安全的同时，进一步探索好大数据的集存、收集包括挖掘应用相关的模式，能够使居民的个人信息、隐私得到很好的保护，让健康医疗大数据在安全保障的前提下，更好地适应经济新常态特别是大众创业、万众创新的“双创”平台上更好地应用发展。
