在线下药房的药品供给方面，阿里健康主要与北京国大药房、北京111医药、大参林、嘉事堂、海王星辰大药房等众多连锁药房合作。
双11期间，北京、广州、深圳，以及之前的杭州4个城市的市民，只需打开手机淘宝，搜索关键词“急用药”、药品名称或相关症状，即可找到附近药房，享受“7X24小时、白天30分钟送达，夜间1小时送达”服务。为了保障消费者急用药需求体验，阿里健康承诺送药服务“超时必赔”。
近年来，作为阿里巴巴在医药健康领域的旗舰平台，阿里健康正在一步步整合阿里系内的医药健康生态资源。
，阿里健康与天猫签署了天猫医药馆的代运营服务协议；5月，宣布收购天猫“蓝帽子”保健食品业务；4月，在钉钉企业服务市场开启“健康医务室”，为企业用户开启问医、购药、体检等一站式健康解决方案；同年5月，阿里健康再度宣布收购天猫医疗器械类目。
而在9月的云栖大会上，阿里健康与阿里云联合表示将共建ET医疗大脑2.0，全力深耕医疗AI业务。此外，今年10月15日，阿里健康与余杭区卫计局、支付宝共同开发“全流程刷脸就医”功能，在余杭第一人民医院正式上线。10月20日，阿里健康启动面向医疗AI行业的第三方人工智能开放平台，面向医生和科研人员、开发者提供基于人工智能的应用和服务。
阿里健康相关工作人员表示，在这次合作中，借助饿了么蜂鸟最后一公里的配送能力，阿里健康得以实现多个城市的标准化药品配送服务。这其中，饿了么蜂鸟通过充足的运力网络和技术算法，进行实时运力调配，可以确保服务时间的稳定性。而阿里健康联动线下药房，进行商品库存和出货管理，保障消费者用药多样性的需求，并额外提供超时必赔的承诺。
之前，阿里健康已经在医药新零售领域开启了探索模式。5月，阿里健康联合甘肃德生堂、江苏百佳惠苏禾、新疆百草堂等65家连锁药店，成立“中国医药O2O先锋联盟”。近期，阿里健康还通过投资入股漱玉平民、华人健康、贵州一树等区域连锁药房，摸索打通新零售全链路。借助饿了么的最后一公里配送能力，阿里健康进一步夯实了其在医药新零售的基础建设。
随着中国医药O2O先锋联盟在供应链整合、分钟级药品配送、会员管理等领域的不断尝试，新零售方向得到越来越多的连锁药房认同。截至10月，联盟合作连锁药店已达200家，覆盖100多个城市、3万家药房。其中数千家药店已在淘宝手机客户端开通O2O店铺。
今后，除了为药房配置急送药、执业药师在线值班等服务外，“阿里健康还会将更多的服务能力、更多的新技术应用输出给合作伙伴，提升药店的运营效率，给用户带来更大价值。” 阿里健康医药电商事业部负责人汪强说。
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