导读肠道微生态被称为肠道的另一“器官”，有百万亿微生物定居在肠道内，对宿主的肠道菌群环境甚至整个个体产生重要的影响。虽然，肠道微生态的细胞数量仅有个体细胞数量的10倍，但是其基因编码数量是人类的100倍以上，所以肠道微生物及其编码分子有巨大的潜能影响肠道菌群环境和系统环境。
肠道是人体消化吸收营养的“供应站”，管理好肠道是控制慢性疾病的关键途径。除此之外，肠道还是机体免疫应答的重要场所。据文献介绍，肠道相关淋巴组织，其由集合淋巴结、独立淋巴滤泡、肠系膜淋巴结等组成，占了人体免疫系统的80%左右；而且人体70%的sIgA位于肠道之内。可见，肠道具有巨大的免疫潜能，可以有效地抵抗病原体毒素及其代谢物的入侵。而肠道菌群，无论是在能量利用方面还是在肠道粘膜免疫系统成熟方面均发挥了至关重要的作用。
科学管理好肠道，可以有效控制慢性病。换句话说，要防治慢性病就要维持胃肠道菌群的平衡。虽然肠道共生菌含有大量的抗生素抵抗基因，但是抗生素的使用仍然会使肠道微生物迅速发生显着改变，所以，避免抗生素的滥用非常重要。除此之外，饮食发挥了重要的作用。有一句话说，“我们吃什么，微生物吃什么”，比如低纤维饮食可能饿死体内的这些微生物。
一项关于西方和非洲儿童的研究表明，长期的西方饮食即蛋白高脂肪低碳水化合物饮食会改变肠道微生物构成。另一项研究也表明近期的研究表明高蛋白、高脂肪饮食促进有害菌的生长。这也许可以解释为什么西方国家肥胖、糖尿病等慢性病及自身免疫病等疾病的发病率高于其他国家。同时，短期饮食的改变也会在24小时内使得肠道微生物发生快速变化，但是饮食恢复后，肠道微生物可以随之恢复平衡。
有研究显示，地中海膳食模式组成有利于肠道菌群平衡的维持。其主要富含植物性食物，包括谷类 、水果、蔬菜、豆类、果仁等；每天食用适量的鱼、禽、少量蛋、奶酪和酸奶；每月食用红肉（猪、牛和羊肉及其产品）的次数不多，主要的食用油是橄榄油。
所以，饮食对于肠道微生物的构成有重要的影响，进而影响微生物和宿主的相互作用，对健康和疾病发挥作用。
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