增值税专用发票的抵扣方式目前有两种：
一是通过增值税发票选择确认平台进行勾选确认。
二是扫描认证。
请纳税人一定注意：
认证相符或进行勾选确认的增值税专用发票，纳税人应在认证相符或勾选确认的纳税所属期内抵扣，逾期的其进项税额不予抵扣。
一、增值税发票选择确认平台进行勾选抵扣法
适用范围
1、纳税信用A级、B级、C级的增值税一般纳税人
2、5月1日新纳入营改增试点、尚未进行纳税信用评级的增值税一般纳税人，4月30日前不需进行增值税发票扫描认证。
纳税人取得销售方使用新系统开具的增值税发票(包括增值税专用发票、机动车销售统一发票)，可登录增值税发票选择确认平台（https://fpdk.）进行勾选确认，查询、选择用于申报抵扣或者出口退税的增值税发票信息，未查询到对应发票信息的，仍可进行扫描认证。
您也可以登录纳税人网，点击办税广场下方的“取消认证”进入增值税发票选择确认平台。
操作简介
1、用户使用可以连接互联网的电脑，在USB接口插入金税盘或者税控盘登录增值税发票选择确认平台网站（每次只能同时插入一个金税盘或税控盘，且不要同时插入其它数字证书，如银行U盾等）；
2、首次登录平台时，纳税人需确认和填写企业的基本信息，并选择是否设置平台密码及找回问题。平台密码设置后纳税人需输入金税盘或税控盘的CA密码（非开票软件密码）和平台密码的双重密码后，进行平台登录。
3、纳税人可通过“发票勾选”或“批量勾选”模块，在可勾选和确认时间段内，按照税款所属期对需要抵扣（或退税）的发票进行勾选处理，在“确认勾选”之前可以多次勾选或撤销勾选；
4、当期勾选、确认的开始时间为您完成上一期申报之后（平台将自动获取您的申报完成情况），结束时间为您完成当期申报之后；若您一直未进行当期申报，当期勾选确认的截止时间为当期申报截止期当天。当平台成功获取您当期申报完成的结果时，将立即开启您下期的勾选确认操作窗口，请您关注平台中“税款所属期”的变化。
5、纳税人可在每个税款所属期的勾选和确认操作窗口期内，对当期勾选的发票进行多次确认。（必须手工确认）
6、您可以实时通过抵扣统计模块查询当期已认证的所有发票数据，作为您当期进行申报抵扣的依据。抵扣统计模块的统计表中包含了对应税款所属期勾选认证（即，勾选确认）的数据和扫描认证的数据。勾选认证和扫描认证会触发该统计表的更新，请您关注统计表右上方的报表更新时间。其中，勾选认证数据会在您完成确认操作后的当天准时更新，扫描认证的数据会在您完成扫描的当晚进行更新。
7、抵扣统计模块中的异常发票清单，是勾选确认后变为异常（含作废、失控、红冲和异常）的发票，不能作为当期的有效抵扣依据。建议您下载发票清单查看明细，并对此部分数据进行相应处理。
登录增值税发票选择确认平台右上角有“操作手册”，内有详细说明，可以下载查看。
注意事项：“勾选确认”每个月可以执行多次，注意申报前将需要抵扣的发票都要选择确认，一旦申报成功，再次“勾选确认”的为下一所属期的发票。
企业点击确认操作时，会弹出三个选择项“未完成申报”，”已完成申报“，”不确定“，请企业根据实际申报完成情况，进行选择：
1、若您未完成本期申报工作，请选择“未完成申报”选项，本次确认提交成功，属期为当期;
2、若实际情况为已完成本期申报工作，请选择“已完成申报”选项，系统会认为您已完成本期的勾选认证工作，会自动回退已勾选未确认的发票数据，并将当前税款所属期自动转到下期，您勾选认证的发票可在下期进行操作，请慎重选择;
3、若您无法确定实际申报工作是否完成，请选择“不确定”选项，系统将不做任何处理。
提示：
如果您误点“已完成申报”选项后，符合以下条件的，点击“回退税款所属期”按钮，即可回退至当期税款所属期，重新勾选确认：
（一）跳转到下期后，没有在“确认勾选”模块进行过确认已勾选发票的操作；
（二）系统获取到的当期申报结果为“未申报”；
（三）在本平台确认勾选时，手工误点击“已完成申报”选项；
（四）回退功能在征期内有效。
来源：北京朝阳税务
