现在的疫苗生产还是主要依赖鸡蛋吗？
holysilence
这个属于生物制药工艺开发过程（Process Development）中的一个问题。 我的同行@崔翔 已经回答的很不错了（查看回答）。
介绍一下背景知识：
疫苗本身的作用机理类似于防火演习，通过模拟将来的微生物入侵（病原的输入），让身体做好准备，准备好武器（产生抗体），等真正的危险来临之际，身体就可以迅速做出反应，在病原造成破坏之前将其干掉。
疫苗类似于防火演戏的道具，它必须能模拟出真实情况（能刺激产生正确的抗体）。按照疫苗（抗原）的性质，大概分以下几种
灭活疫苗：把真正的病原微生物杀死，注射入人体。好处是最简单快速，坏处是作用往往不够强。
减毒活疫苗：把真正的病原微生物改造，让它们可以感染，但是不会让人发病。好处是作用强，坏处是需要漫长的开发过程，而且可能会有安全性问题（发生毒力逆转）。
亚单位疫苗：也包括了衍生出的假病毒（VLP）疫苗。把微生物的结构上的一个或者几个蛋白拿出来。好处是安全，坏处是研发周期长，而且作用往往不强。
可以看到，前面两种疫苗，都需要一个饲养（培养）真正病原微生物的过程，无论它本身是减毒的还是一会要被灭活的。本题中的鸡胚(egg-based)生产工艺就是在这个过程中（业内称上游工艺，upstream process）使用的一种技术，而且只针对病毒类疫苗。算是疫苗工艺中比较传统的一种上游培养技术，只是因为流感而比较出名。
下面来回答问题：
事实上题主这个问题，在业界已经讨论了十几年了，因为做疫苗的人都在忧虑全球流感大爆发，所以主要以流感为主，目前基本算是有了些共识。鸡胚疫苗的最大优点是安全而有效，而 Safety 和 Efficacy 这两点是疫苗的根基，这也是其长盛不衰的原因。但是其缺点也确实很明显的：
原料的供应链：鸡蛋的供应是最大的限速步骤，这种鸡蛋不是大家超市买的，而是洁净度最高的 SPF 鸡蛋。如果流感全球爆发，肯定是顶不住的。
禽流感的忧虑：如果是 H5 类型的流感爆发，这种流感病毒很有可能会杀死鸡胚，导致整个鸡胚生产线无法使用。
过敏性：有对鸡蛋过敏的人无法使用。
使用生物反应器，用哺乳动物细胞(cell-based)来替代鸡胚，用来生产病毒，是产业界无可避免的趋势（虽然进展略显缓慢），它的主要优点如下：
无原料供应问题，只需要培养基，一管细胞扩增生长。
无禽流感的担忧，也不会造成过敏。
如果是亚单位疫苗，可以形成非常短的响应周期，可以进行紧急响应。
如同硬币的两面，优点如此，缺点也同样存在：
安全性和有效性，疫苗的两大根基还不如鸡胚牢固。毕竟是个新的东西，FDA 很谨慎，各项指标也更严格，对下游工艺的挑战也比较大。
完全不同的生产线导致额外投资。一条鸡胚的生产线运行的很好，在没有流感大爆发的情况下，大家都没有心思去换，这是一个循序渐进的过程。
前面@崔翔 提到的成本问题，虽然也是原因之一，事实上并不是很核心。因为公司的成本合算（COG calculation）中，物料成本（material cost）只是很小的一部分，大部分都被厂房折旧，研发投入等等占去，也就是运营成本（operation cost）所占去。如果说成本高，更多的是指更新生产线所需要的成本。
总结：细胞培养技术（cell-base）取代鸡胚培养技术（egg-base）是个大的技术趋势，但是一个渐进的过程，如果没有外界的刺激（比如流感大爆发），会用很长时间。
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