牛首山有寺院肇始于南朝初年。唐朝贞观时期，寺院规模宏大，名为佛窟寺，为禅宗之前“牛头禅”发祥地。北宋后易名宏觉寺。南宋毁于战乱，明代复兴。时至1856年，寺院毁于洪杨之乱，香火中断百年。恭逢盛世，为继承传统文化，江宁区重建文化胜地。开山，全面峻工。征得文化界知名人士和佛教界高僧建议，以供奉于牛首山地宫的佛顶舍利命名，取名佛顶寺。
佛顶寺为牛首山主要建筑之一，占地面积六十八亩，建筑面积近四十亩，仿唐风格，传统中轴线格局。共有殿堂七座，外围有僧竂、斋堂等建筑。
拾级而上，是以四大天王命名的天王殿，正面供奉弥勒佛真身像，因佛顶真骨舍利供奉于牛首山地宫，故供弥勒佛真身像，不同于他山所供化身布袋和尚像。背面供奉“三洲感应”护法韦驮菩萨，身着将军服，为保护佛教的护法菩萨之首。佛顶寺韦驮菩萨手执宝杵立地，寓意挂单僧人一宿两餐。
四大天王，增长天王：手持宝剑，剑代表智慧，表法为用智慧宝剑断除烦恼，福慧自然增长，故名增长天王。广目天王：手执龙，龙代表变化，表法为用变化的心态应对无时无刻不在变化的世界；同时要有远大目光，勇猛精进，积极进取，不被时代淘汰，故名广目天王。持国天王：手执琵琶，琵琶弹奏出美妙的音乐，须将弦调到恰到好处，过紧过松都弹奏不出美妙音乐。表法为学习知识、掌握技能、修学佛法，须找到契入点，合乎要领。儒家提倡“中庸之道”、佛家阐述的“中道”。找准契入点的同时，坚持不懈，必有成就。多闻天王：手持伞盖，伞表法为保护好自己的清净心，不受外界不良因素的染污，多听闻学习善法，多学习、多领悟，故名多闻天王。四大天王脚下踩踏的各种形态的怪人物，代表我们内心的贪、瞋、痴、慢、疑、嫉妒、障碍等，是某些人心中的魔鬼。
“大雄”为释迦牟尼佛之尊号，大力大慈悲之意。“宝”代表佛、法、僧三宝，“殿”为供奉圣贤之处，故名“大雄宝殿”。大殿正中供奉释迦牟尼佛，前方供奉释迦牟尼佛的两位弟子，年长者为苦行第一的迦叶尊者，下首供奉多闻第一的阿难尊者。释迦牟尼佛涅槃后，迦叶、阿难两位尊者负责，共五百大阿罗汉，将释迦牟尼佛四十九年所说的一切法，结集为三藏教典。
与释迦牟尼佛并坐的两尊菩萨，上首为文殊菩萨，骑青狮，文殊菩萨智慧第一。狮子为兽中之王，“狮子窟中无异兽”，狮子一吼百兽皆惊，文殊菩萨的智慧像狮子一样威力无穷。骑白象者为普贤菩萨，此象六牙，代表佛教中的六度，普贤菩萨行愿第一：“象王行处绝狐踪”。两大菩萨分别代表智慧与行愿，能够完整地体现佛法的内涵。两侧供奉十八罗汉，为五百罗汉之代表，他们于佛前发愿，永住世间，护持正法。佛教中五百罗汉是纪念释迦牟尼佛涅槃后，第一次结集经、律、论三藏的五百罗汉。十八罗汉以不同的形态出现，比如挠痒、敲耳、吉祥坐、降龙、伏虎等。罗汉已进入解脱境界，自在无碍......
大殿背面供奉观世音菩萨，观世音菩萨大慈大悲的精神，被视为大乘佛教的根本。此塑像为水月观音（亦称自在观音）。观水中之月亮，思量如何度化苦难众生。左边男童名善财，经典记录其出生时，家中涌出各种财宝，故取名善财。善财童子受普贤菩萨指点，先后参访五十三位大善知识，向大善知识请教学习。所谓“法门无量誓愿学”，昭示着年青年僧人要学习善财勤奋刻苦的学习精神。右边女童为龙女，修学佛法非常精进，领悟力极强。观世音菩萨身后有不同形象画面，为观世音菩萨三十二应身，菩萨针对不同的众生，现不同身相，说相应法门。
