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【文献速递581】基于CRISPR技术的CD8 T细胞全基因组筛选发现免疫疗法新靶点

时间:2023-09-26 04:29:23

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【文献速递581】基于CRISPR技术的CD8 T细胞全基因组筛选发现免疫疗法新靶点

Light 说

在过去几年里,免疫疗法彻底改变了癌症的治疗格局。许多患者原先已病入膏肓,无药可治,但在免疫疗法面前,他们却能奇迹般逃脱死神的魔爪,甚至能够数年无癌。但免疫疗法并非万能药。在一些患者里,它极为有效。但在剩下的患者中,它几乎没有作用。为了了解背后的原因,研究人员对免疫疗法的主力军——T细胞进行一次“地毯式”的筛查,利用基于CRISPR技术的方法,进行基因组的编辑和高通量的筛选。

具体来看,研究人员们首先从小鼠中分离出CD8阳性的免疫T细胞(它们是免疫疗法的主力),然后使用CRISPR技术对其进行全基因组水平上的编辑。这些经过编辑的T细胞在短暂的培养后,被输注回带有肿瘤的小鼠体内。其中一些小鼠的病情得到了缓解,表明输注进小鼠体内的免疫T细胞起到了抗击肿瘤的效果。随后,研究人员们取出了小鼠的肿瘤,并对肿瘤环境中的T细胞进行了分析,看看哪些基因在CRISPR技术的编辑下出现了变化。它们之中,可能就有抗击肿瘤的奥秘。分析结果中,我们发现了PD-1和Tim-3等已知的经典靶点,这也从侧面支持了这套筛选系统的可靠程度。

在已知的靶点外,本研究也找到了一些新的靶点,其中此前研究较少的DHX37基因是一个RNA解旋酶,一旦T细胞内的这个基因被敲除,这些T细胞就会在体内展现出有力的抗肿瘤活性。考虑到研究人员们使用的是“三阴性乳腺癌”的疾病模型,在通常情况下极为难治,这样的抗肿瘤活性显得难能可贵。

研究最后指出这些结果表明了其CRISPR系统在高通量筛选免疫疗法靶点上的有效性。PD-1与Tim-3在筛选结果中具有较高的评分,也表明了这套筛选系统的可靠。对于新筛选出的潜在靶点DHX37蛋白,由于尚没有针对它的小分子化合物,因此通过体外进行基因编辑,削弱其活性,有望成为设计新型免疫疗法的一种思路。在DHX37之外,研究团队们也正在探索其他筛选出的基因具有怎样的抗肿瘤潜力。针对这些靶点,新型的免疫疗法也正在开发之中。

SystematicImmunotherapy Target Discovery Using Genome-Scale In Vivo CRISPR Screens in CD8T Cells

图片来源:文献原文

CD8 T cells play essential roles in anti-tumor immune responses. Here,we performed genome-scale CRISPR screens in CD8 T cells directly under cancer immunotherapy settings and identified regulators of tumor infiltration and degranulation. The in vivo screen robustly re-identified canonical immunotherapy targets such as PD-1 and Tim-3, along with genes that have not been characterized in T cells. The infiltration and degranulation screens converged on an RNA helicase Dhx37. Dhx37 knockout enhanced the efficacy of antigen-specific CD8 T cells against triple-negative breast cancer in vivo. Immunological characterization in mouse and human CD8 T cells revealed that DHX37 suppresses effector functions, cytokine production, and T cell activation. Transcriptomic profiling and biochemical interrogation revealed arole for DHX37 in modulating NF-κB. These >

基于CRISPR技术的CD8 T细胞全基因组筛选发现免疫疗法新靶点

CD8 T细胞在抗肿瘤免疫应答中起重要作用。本文研究中,我们对肿瘤免疫治疗环境中的CD8 T细胞中进行全基因组的CRISPR筛选,识别肿瘤浸润和脱粒的调控分子。体内筛选对典型的免疫治疗靶标进行更有力的验证,如PD-1和Tim-3,以及其他尚未在T细胞中表征的基因。渗透和脱粒的主要调控基因是RNA解旋酶DHX37。DHX37的敲除增强了抗体特异性CD8T细胞对体内三阴性乳腺癌的疗效。小鼠和人CD8 T细胞中的免疫学表征揭示DHX37抑制效应子功能、细胞因子产生和T细胞活化。转录组学分析和生物化学研究揭示了DHX37在调节NF-κB中的作用。本研究数据显示高通量体内基因组筛选发现了免疫治疗靶点,并确定DHX37是CD8 T细胞的功能调节因子。

文献来源

DOI:10.1016 / j.cell..07.044

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