今天是第1214期日报。
适量喝红酒与肠道菌群多样性增加相关
Gastroenterology[IF:19.233]
① 分析英国TwinsUK队列916名双胞胎女性，发现红酒摄入与肠道菌群α多样性正相关，偶尔喝也有作用；② 白葡萄酒也与菌群α多样性正相关但关联较弱，其它酒无此相关性；③ 红酒摄入伴随3个菌属的含量改变，尤其与Barnesiella增多显着相关；④ 红酒摄入与BMI及乳糜微粒水平负相关，菌群α-多样性可能有部分介导作用；⑤ 在另两个千人队列中验证了喝红酒者的菌群α多样性显着高于不喝红酒者；⑥ 这些现象可能与红酒富含的多酚类物质有关。
Red Wine Consumption Associated With Increased Gut Microbiota α-diversity in 3 Independent Cohorts08-28,doi:10.1053/j.gastro..08.024
【主编评语】Gastroenterology发表的一项通讯研究，分析了英国TwinsUK队列中900多名双胞胎的喝酒情况与肠道菌群多样性的关系，发现喝红酒与菌群α多样性增加显着相关，可能介导了红酒对体重和脂代谢的潜在益处。研究者认为，红酒富含的膳食多酚可能在其中起主要作用。（@李丹宜）
Nature子刊：设计稳定无毒的抗菌肽杀灭耐药菌
Nature Biotechnology[IF:31.864]
① 阳离子α-螺旋抗菌肽(AMP)存在结构不稳定性、蛋白水解降解和非特异性膜裂解毒性等问题；② 本文提出了基于magainin II的58个stapled AMP(StAMPs)成员并应用结构-功能-毒性测量方法，设计稳定、抗蛋白酶、有效和无毒的StAMP算法；③ 该方法设计的一种铅双重StAMP可以杀死多种耐药的革兰氏阴性病原体，并在小鼠毒性研究中没有观察到溶血或肾损伤；④ 仅输入氨基酸序列产生了一系列膜选择性的StAMPs，展现了设计平台的通用性。
Design of stapled antimicrobial peptides that are stable, nontoxic and kill antibiotic-resistant bacteria in mice08-19,doi:10.1038/s41587-019-0222-z
【主编评语】抗生素耐药问题是当今微生物组研究最热点的问题之一，本文提出人工设计抗菌肽角度攻克耐药菌，在小鼠实验中取得较好成功，较抗生素相比更不容易产生耐药抗性，是开发新型抗生素、噬菌体疗法等方法外的有效补充，是人类对抗耐药菌又一有利武器。（@刘永鑫）
Nature子刊：现代饮食和医疗系统促进艰难梭菌的演化
Nature Genetics[IF:25.455]
① 分析906株艰难梭菌的基因组，根据1322个核心基因将其分为4个进化种群PG1/2/3/4；② PG4与其它3个种群在进化上分离的更早，把PG1/2/3称为艰难梭菌分支A，PG4称为分支B；③ 两个分支的物种形成过程与核心基因的正选择有关，这些基因主要参与孢子形成和简单膳食糖的代谢；④ 与分支B相比，分支A的细菌在利用单糖（葡萄糖、果糖）时能产生更多的孢子、有更强的肠道定植能力，且其孢子对消毒剂有更强的抗性，从而更易在人群中传播。
Adaptation of host transmission cycle during Clostridium difficile speciation08-12,doi:10.1038/s41588-019-0478-8
【主编评语】肠道细菌如何在演化中获得更强的宿主适应能力？Nature Genetics近期发表的研究表明，能引起常见医院感染之一的肠道细菌艰难梭菌，在进化上形成了两个主要分支，其中一个分支演化出了更多利于其在人群中传播的特性，比如有更强的抵抗消毒剂的能力，并能更好地利用现代人饮食中的简单碳水化合物（如葡萄糖和果糖）来促进自身的传播和定植，说明现代医疗和饮食习惯在艰难梭菌的演化中施加了选择压力。（@李丹宜）
Nature子刊：5羟色胺调节产孢细菌的肠道定殖
Nature Microbiology[IF:14.3]
① 口服5羟色胺或5羟色胺转运蛋白缺陷可增加小鼠肠道中的5羟色胺水平，并增加肠道菌群中产孢细菌的相对丰度；② 鉴定出产孢细菌中的一个成员——Turicibacter sanguinis可摄取5羟色胺，5羟色胺可降低T. sanguinis的产孢因子及膜转运蛋白的表达；③ 上述效应均可被氟西汀（5羟色胺再摄取抑制剂）抑制，另外，氟西汀抑制了T. sanguinis在小鼠肠道中的定殖；④ T. sanguinis的定殖影响了小鼠肠道中包括脂质及胆固醇代谢在内的多个通路的表达。
Intestinal serotonin and fluoxetine exposure modulate bacterial colonization in the gut09-02,doi:10.1038/s41564-019-0540-4
【主编评语】肠道菌群调节肠道中的5羟色胺水平，但5羟色胺如何影响肠道菌群尚未明确。Nature Microbiology上发表的一项最新研究，发现肠道中的5羟色胺水平可影响肠道中的产孢细菌丰度，并可调节特定细菌在肠道中的定殖。（@沈志勋）
宿主遗传影响肠道菌群和胆汁酸谱
PLoS Genetics[IF:5.224]
① 对400只遗传多样化的小鼠进行高脂高蔗糖喂养，分析粪便菌群及血浆和盲肠内容物中的胆汁酸（BA）组成，发现肠道菌群和胆汁酸与宿主遗传相关；② 数量性状基因位点（QTL）分析筛选到多个与肠道菌和胆汁酸均相关的基因组位点，包括回肠BA转运子基因Slc10a2；③ 不同遗传背景小鼠中，Slc10a2基因表达的差异可影响肠道Turicibacter细菌和血浆胆酸的水平；④ 中介分析发现BA和Turicibacter之间存在相互作用，高浓度BA可抑制Turicibacter细菌生长。
Genetic determinants of gut microbiota composition and bile acid profiles in mice08-28,doi:10.1371/journal.pgen.1008073
【主编评语】肠道菌群的个体间差异，在一定程度上与宿主遗传因素有关。PLoS Genetics发表的一项研究，系统分析了与肠道菌群和胆汁酸谱相关的小鼠遗传因素，表明特定的宿主基因变异可通过影响胆汁酸代谢和肠腔内的胆汁酸含量，来影响肠道细菌，为研究宿主-菌群互作提供新视角。（@李丹宜）
复杂的肠道菌群保护小鼠肝脏
FASEB Journal[IF:5.391]
① ASF小鼠（菌群简单）和SPF小鼠（菌群较复杂）中，通过胆总管结扎（BDL）或四氯化碳（CCl4）诱导肝纤维化，分析门静脉压力（PP）、门体分流（PSS）和组织变化；② BDL或CCl4处理后，两组小鼠的PP、PSS和肝脏胶原沉积均增加；③ 但ASF组的PP、纤维化程度和标志物表达均高于SPF组，与ASF小鼠中较高的肝脏免疫细胞活化及肠上皮紧密连接蛋白表达降低有关；④ 在晚期慢性肝病模型中，ASF小鼠的肝损伤、纤维化和门脉高压比SPF小鼠严重。
Attenuated fibrosis in specific pathogen-free microbiota in experimental cholestasis- and toxic-induced liver injury08-20,doi:10.1096/fj.01113R
【主编评语】慢性肝病中存在肠道细菌移位，可引起炎症促进肝纤维化，据此推测，简单的肠道菌群或许在肝脏疾病中有保护性作用。但FASEB Journal近期发表的研究表明，拥有复杂肠道菌群的小鼠，在诱导肝损伤和肝病时，其肝纤维化程度更轻，与更好的肠道屏障功能和更少的肝脏免疫细胞活化有关，再次印证了多样化的肠道菌群的促健康作用，也为靶向肠道菌群改善肝脏疾病的干预疗法提供思路。（@李丹宜）
糖化血红蛋白升高或影响年轻人的认知功能
Molecular Psychiatry[IF:11.973]
① 纳入1206名健康年轻人（平均年龄为28.8岁，45.5%为男性）参与研究；② 发现糖化血红蛋白水平（HbA1c）与认知功能指标呈显着负相关；③ 控制年龄、性别、体重指数、种族和教育程度后，HbA1c水平的升高与白质的部分各向异性（FA）显着而广泛的降低有关，且FA降低与认知功能的测量结果一致；④ 低于糖尿病诊断阈值的低度HbA1c变化与健康年轻人的认知能力和白质完整性有关，提示HbA1c的变化可能对大脑生理产生持续负作用。
Variation of HbA1c affects cognition and white matter microstructure in healthy, young adults08-29,doi:10.1038/s41380-019-0504-3
【主编评语】血清中的糖化血红蛋白水平与糖尿病患者的认知功能相关。Molecular Psychiatry上发表的一项最新研究，发现在健康人中，糖化血红蛋白水平的升高也与认知功能的降低及白质微结构的变化相关。（@沈志勋）
Cell子刊：发育中的肠道如何吸收蛋白质
Developmental Cell[IF:9.19]
① 一种名为富含溶酶体的肠上皮细胞（LRE）的特化肠道细胞，可通过受体介导的内吞及液相内吞将饮食中的蛋白质内化；② 在LRE中鉴定出一套保守的内吞机器——由Cubilin、Amnionless及Dab2组成的复合物，对于LRE摄取蛋白及幼年斑马鱼的存活是必需的；③ Cubilin/Amnionless介导LRE的蛋白质摄取，Dab2介导了受体介导的内吞及液相内吞；④ 在乳鼠中条件性敲除Dab2损伤LRE的功能，可导致小鼠发育不良及严重的蛋白质缺乏症（与人类的希奥科病相似）。
Lysosome-Rich Enterocytes Mediate Protein Absorption in the Vertebrate Gut08-29,doi:10.1016/j.devcel..08.001
【主编评语】在肠道还未发育成熟时，饮食中的蛋白质是如何被吸收的尚未明确。Developmental Cell上发表的一项最新研究，发现在肠道中有一种特化的细胞——富含溶酶体的肠上皮细胞（LRE），通过内吞作用吸收蛋白质，对于发育中的斑马鱼及小鼠的存活及成熟至关重要。（@沈志勋）
感谢本期日报的创作者：李丹宜，刘永鑫，张宇微，沈志勋，何茂章，迟卉，this little piggy
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