缅甸新军人政权上台后，先后与17支少数民族武装达成协议，实施停火。果敢同盟军是第一支与政府和解的少数民族武装，因此，缅政府高层一直对果敢高度关注，更将果敢定位为解决境内少数民族武装组织问题的突破口和“试验场”。
从1991年开始，缅政府为逐步消除统一障碍，对果敢同盟军长期坚持“武装包围，经济封锁，以压促变，分化瓦解”的政策，并将果敢作为推进缅北罂粟禁种的切入点，不断削弱果敢同盟军的力量，最终于8月彻底控制了果敢地区。
身份歧视
缅政府对果敢地区生活的不同民族区别对待，对其主体民族果敢族采取身份歧视政策。
7月，缅政府派人到果敢地区开展办理公民身份证业务，很多果敢族群众能够领班的只是临时身份证，俗称“白卡”。
缅甸的“身份证”分为红绿白等三种颜色，“白卡”是临时身份证，持卡人为非国家正式公民身份，不具备选举权和被选举权。缅政府为果敢族群众办理的身份证大都是“白卡”，而属于缅甸国家正式公民身份的“红卡”，却只办给居住在果敢地区的傣族、崩龙族、傈僳族等少数民族。
根据底果敢自治区人口调查统计资料，已经持有“红卡”国民身份证47408人，占总人口的49.75%。
政治分化瓦解
缅政府把果敢同盟军视为心腹之患，不断利用矛盾，分化瓦解，各个击破，以达到削弱同盟军实力并最终实现统一的目的。
纵观果敢同盟军4次分裂内讧，发现都有缅政府“挑拨矛盾，坐山观虎斗，渔翁得利”的清晰脉络。
从1989年至间，禁毒问题多次成为缅政府实施分化打压的武器，缅政府往往根据需要将“毒枭”帽子扣在打击对象头上。
1991年5月，缅政府宣称彭家声“假禁毒，真贩毒”，由罗星汉出面挑拨彭家声杨茂良之间的矛盾，企图将彭家声赶下台。
1995年8月，勐撒拉叛乱事件爆发，从果敢同盟军分裂出来的勐古保卫军刚成立就获得了缅政府的承认，取得合法地位。
1995年11月，杨茂良主政果敢的地位发生动摇，彭家声欲带兵返回果敢推翻杨茂良，事先征得了缅政府的许可，缅政府表示“欢迎鼓励其重返果敢”。
1996年后，缅政府长期收买拉拢同盟军领导人，积极培植反对彭家声的势力。，缅政府将几位特区政府高层领导表示效忠的信件转给彭家声，试图挑拨同盟军高层矛盾。
“8·8武装对峙”前夕，缅政府通过封官许愿、重金收买等方式，积极拉拢同盟军内部的和谈派领导人，孤立主张对抗的彭氏家族。
在1990年－2000年间，缅政府还坐视、纵容周边少数民族武装介入果敢内斗，进一步搅乱果敢局势。
经济严密封锁
在地理上，果敢地区与缅政府控制区有萨尔温江(怒江)自然屏障的阻隔，导致缅政府封锁果敢地区极为便利，物品走私较为困难。缅政府在进出果敢的交通要道上层层设卡，人员物资往来受到严格审查。
为避免果敢特区政府征收过境税，缅政府严禁政府控制区内出产的木材、矿石、珠宝玉石等大宗商品物资进入果敢或过境果敢，严禁果敢所产的茶叶、核桃等商品进入政府控制区。彭家声投资开办的昔娥卷烟厂生产的卷烟产品就被禁止销往政府控制区，导致卷烟厂市场狭窄，销售困难。
中缅之间贸易往来主要经由德宏州瑞丽口岸，而临沧地区和果敢特区的边境贸易一直处于低水平发展状态，至，与果敢地区接壤的镇康县边贸总额仅1.5亿元人民币，而同期瑞丽对缅边贸就达32.44亿元人民币。
同时，联合国及国际社会对果敢特区的大额援助项目，缅政府有时也会阻挠和克扣。4月，国际社会直接援助果敢特区500万元替代种植资金，缅政府就此致函特区政府，提出异议。要求特区政府不经上级批准，不得私自接收国际援助。
军事进占吞并
缅政府在滚弄等果敢同盟军辖区周边驻扎大批尖锐部队，对果敢特区保持军事高压态势，并寻机进占吞并。
1995年11月，趁杨茂良向政府投降之机，政府军迅速派兵占领了清水河至老街公路沿线制高点，修建永久性兵营和工事，并长期驻扎，形成了同盟军和缅甸政府军共治果敢的局面。
2000年11月，政府军借“黑勐龙”事件占领了江西(勐古)地区，同盟军从此失去了对江西的控制，地盘大幅缩减。此后几年间，政府军在果敢的驻地扩展到了包括北部山区的果敢全境，截止6月底，驻扎果敢的政府军属缅东北军区老街军分区，驻军有6个营共计2300余人，军事力量对比上具有压倒性优势。
政府军控制着从老街市至幕泰乡193公里地段上所有的军事制高点，主要据点有老街、大水塘、仰况、大坝桥、拱掌、谷家渡、幕泰等，在果敢境内共有大小据点50多个。
老街周边山头上就有4个政府军兵营，老街市区经常可以见到身着政府军制服的士兵在巡逻执勤，果敢同盟军总部就时刻处于政府军枪口威胁之下。
“8·8武装对峙”之前，政府军的军事进占更是步步紧逼，不断挤压果敢同盟军的活动空间。
7月8日，联邦政府军警开始进入清水河口岸执勤站岗；7月28日，政府军开始进驻果敢最北端的杏塘；8月8日，进驻杨龙寨口岸，至此，政府军已经占据了果敢地区所有战略要地。8月27日－29日，经过2天半的武装冲突，政府军将抵抗派彭氏家族逐出果敢，完全控制了果敢全境；12月，通过改编，政府军彻底吞并了果敢同盟军。
