1932年2月1日，根据中革军委命令，闽西苏维埃政府军事部（原闽粤赣军区）改称闽西军区。罗炳辉任总指挥，谭震林任政委，尤瑞轩任参谋长，谭政任政治部主任。下辖：红12军（辖第34、36师），罗炳辉兼任军长，谭震林兼任政委；随营学校（后改称彭杨红军学校），杨海如任校长，刘瑞生任政委；独立7师（领导人不详）。另辖各县独立团。
1932年4月，闽西红军独立7师撤销，以军区独立团和闽西红军独立7师第2、4团组建红12军35师（未设师部）。闽西红军独立7师第1团改称军区红军独立1团；武平红军独立团改称军区红军独立2团；龙岩地方武装整编为军区红军独立3团；新泉地方武装整编为军区红军独立4团；宁化地方武装整编为军区红军独立5团；太拔独立营扩编为军区红军独立8团。
1932年5月，闽西军区在上杭、永定、武平、新泉地区成立杭永武泉指挥分部（相当于军分区）；在长汀、连城、宁化、清流地区成立汀连宁清指挥分部，分别指挥当地地方武装。同时，以独立1团和永定、龙岩地方武装组建闽西红军独立8师，师部由杭永武泉指挥分部兼。
1932年10月，闽西军区以长汀、连城红军独立团等部队重新组建红军独立7、9师；以军区独立2团、上杭红军独立团（1932年夏编成）等部队组建红军独立10师。此时，军区下辖；彭杨红军学校，杨海如任校长；（上）杭永（定）武（平）（新）泉指挥分部，韩伟信任指挥官；（长）汀连（城）宁（化）清（流）指挥分部，杨遇易任指挥官；独立7师，张瑞标任副师长；独立8师，韩伟信任师长，郭滴人任政委；独立9师，陈树湘任师长，张梁任政委；独立10师，张荣发任师长，张平凯任政委；红12军（辖第34、35、36师），罗炳辉兼任军长，谭震林兼任政委。
1932年12月7日，闽西军区为加强苏区边缘地区的军事斗争，决定将上杭、永定、龙岩地区的游击队合编为杭永岩红军游击纵队，划归杭永武泉指挥分部指挥。
1933年1月，闽西军区改称为福建军区，领导当地的地方武装和群众武装，坚持中央苏区东线的军事斗争。
